Plasmapper


Todos los que trabajamos con genética microbiana nos llenamos rápidamente de plásmidos con múltiples insertos. Al cabo de algunos años, o meses, o semanas (en algunos), nos olvidamos que clonamos y cómo está clonado. Por supuesto que las personas ordenadas (no es mi caso) tienen un registro que permite saber que contiene ese tubo con un rotulo críptico. Este registro puede ser el clásico cuaderno o algún archivo electrónico con la secuencia, al cual siempre es útil acompañar con alguna imagen del plásmido construido. La mayoría utiliza programas como el Vector NTI o el DNAstar, lo que encontré es una alternativa gratuita que corre en la web: el plasmapper. Permite construir mapas de plásmidos a partir de la secuencia del mismo y reconoce genes de resistencia, polilinkers, origenes de replicación y otros caracteres en forma automática por lo que ahorra es trabajo de anotarlos. Si bien no tiene la ventaja del Vector en cuanto a la facilidad de agrupar y relacionar diferentes plásmidos construidos, corre en la web lo que permite utilizarlo de cualquier computadora independientemente de lo que se tenga instalado. En definitiva, es una alternativa a tener en cuenta que puede sacarnos de un apuro.

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Una respuesta a “Plasmapper

  1. che no permite mas de 40kb!!!!

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