TRACA-TRACA


TRACA: transposon aided capture
Siguiendo la linea del metagenoma intestinal, nos preguntamos que pasa con los plásmidos. Muchas de las enzimas y componentes bacterianos se encuentran codificadasen plásmidos. En los enfoques metagenómicos las secuencias de vectores no aparecen o se ven poco representados. El TRACA método utilizan el transposon EZ-tn5 para marcar los plásmidos aislados y recuperarlos en una cepa de E. coli de laboratorio. Con este enfoque metodológico indentificaron un grupo de plásmidos interesentes. Muchos de los cuales no aparecieron en los muestreos de metagenomas. A mi entender un método brillante!!!.

PMID: 17128268

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2 Respuestas a “TRACA-TRACA

  1. Muy bueno fer! Ahi agreguè el link. Por las dudas es;
    http://www.nature.com/nmeth/journal/v4/n1/abs/nmeth964.html

    Lo que es divertido es que se basan en herramientas geneticas muy sencillas. La idea ademas es lindisima porque es sencilla, fijense como se sacan de encima el genomico: aislan todo el DNA y luego le ponen una exonucleasa queno va a poder atacar plasmidos! Muy lindo. Otra cosa es que concuerda con el trabajo de metagenomica del intestino previo: los plàsmidos màs frecuentes son de firmicutes. Los màs abundantes en el intestino humano son los firmicutes.

  2. me gustó el blog! muy didáctico!

    ah! estudiantesquimica.blogspot.com

    estaría bueno saber si entre docentes se discuten cosas de la universidad o si están totalmente colgados de las micropalmeraseaes dormantis, así que lo que sepas, sirve de aporte.
    nos vemos el miércoles.

    Guido

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