Si cambio de lugar, cambio la música: casettes de integrones clase 1 en ambientes contaminados

A principios de los noventa, el trabajo pionero de Ruth Hall en Australia develó que muchos genes de resistencia a antibióticos hallados en cepas multirresistentes de la clínica se encontraban en un mismo locus genético: el integrón. El integron es una estructura genética compuesta por una integrasa y río arriba pero en direccion de transcripción opuesta, varios cassetes con ORF flanqueados por palíndromes imperfectos. La integrasa es capaz de integrar o escindir estos ORFs constutuyendo el integrón una plataforma maleable para la expresion de diferentes genes en casette presentes en el metagenoma. Se han encontrado integrones tanto en el cromosoma como en plásmidos. Hasta hace poco se asociaba integrones casi exclusivamente a resistencia a antibióticos. Acá hay un buen ejemplo publicado en PlosONE de cómo los integrones pueden servir a las bacterias para adaptarse a un ambiente diferente al clínico : estuarios marinos contaminados por casi 100 años consecutivos. Los autores levantan por PCR genes 16s y cassettes de genes de integrones clase 1. Lo que encuentran es que hay muchisimos cassettes pero con funciones bien direrentes a los encontrados en la clínica. Encuentran muchos genes del metabolismo de compuestos aromaticos, trasporte de sustancias y eliminacion de metales pesados como el Hg. El cassette más frecuentemente hallado fue LysR (¡¿?!). Lo que más me gustó del trabajo fue la siguiente figura donde se muestra que la diversidad de cassettes en el ambiente es mucho mayor que la de “especies” bacterianas que en las arqueas. Lo cual nos dice que al menos en este ambiente las bacterias son mucho más elásticas que las arqueas. Muy muy bonito…
Otra cosa, ¿y si sondearamos otros ambientes? ¿Cómo evolucionaria el perfil de cassettes si se dejara de contaminar la Bahía?
Integron gene cassettes and degradation of compounds associated with industrial
waste: the case of the Sydney tar ponds. Koenig JE, Sharp C, Dlutek M, Curtis B, Joss M, Boucher Y, Doolittle WF.
PLoS ONE. 2009;4(4):e5276.

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