Archivo de la categoría: systems biology

Transplante de genoma: convirtiendo una especie en otra!!

Craig Venter, gracias por tu fútbol. Para cuando el Nobel ahí? En el trabajo, que lamentablemente no es gratis y al cual aún no pude acceder, reemplazan el genoma de una célula de Mycoplasma capricolum por el de Mycoplasma mycoides resistente a tetraciclina. Los detalles técnicos aún no los tengo pero cuando pueda lo consigo. Basicamente preparan el DNA completo de la donora y transforman a la célula receptora con PEG y seleccionan con tetraciclina. Seguramente hay muchos más detalles tpecnicos, pero esto abre el camino a la generación de células sintéticas. El abstract acá.

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Juguemos con el Genoma de E.coli: The KEIO collection! (parte II)


NO SE GASTEN EN HACER UNA COLI MUTANTE NUNCA MAS POR FAVOR!!!! El knock out sistemático gen por gen de Escherichia coli K12 W3110 usando red swap (vean la parte I!) generó la colección KEIO. Los tipos no sólo se tomaron el trabajo de hacer la coleccion, también la ofrecen gratis a todo aquel que solicite un clon! Este flor de trabajo se publicó en “Molecular systems biology“. Por si fuera poco, generan mutaciones no polares, porque quitan in frame el cassette de seleccion! La bacteria tiene 303 genes cuya delecion es letal(un 7% del total), 37 de ellos de función desconocida (!!!!). Los muchahcos se centran en mirar un poco estos genes esenciales. Por un lado los agrupan por categoría (segun su posible actividad) y se fijan que porcentaje del total de la categoría es esencial. Tambien miran la OD de cada mutante en medio minimo o en LB. Encuentran cosas rarisimas como mutantes que pueden crecer mucho en medio minino pero muy poco en LB!!!! Bueno recuerden no hacer mas mutantes de coli!!