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Si cambio de lugar, cambio la música: casettes de integrones clase 1 en ambientes contaminados

A principios de los noventa, el trabajo pionero de Ruth Hall en Australia develó que muchos genes de resistencia a antibióticos hallados en cepas multirresistentes de la clínica se encontraban en un mismo locus genético: el integrón. El integron es una estructura genética compuesta por una integrasa y río arriba pero en direccion de transcripción opuesta, varios cassetes con ORF flanqueados por palíndromes imperfectos. La integrasa es capaz de integrar o escindir estos ORFs constutuyendo el integrón una plataforma maleable para la expresion de diferentes genes en casette presentes en el metagenoma. Se han encontrado integrones tanto en el cromosoma como en plásmidos. Hasta hace poco se asociaba integrones casi exclusivamente a resistencia a antibióticos. Acá hay un buen ejemplo publicado en PlosONE de cómo los integrones pueden servir a las bacterias para adaptarse a un ambiente diferente al clínico : estuarios marinos contaminados por casi 100 años consecutivos. Los autores levantan por PCR genes 16s y cassettes de genes de integrones clase 1. Lo que encuentran es que hay muchisimos cassettes pero con funciones bien direrentes a los encontrados en la clínica. Encuentran muchos genes del metabolismo de compuestos aromaticos, trasporte de sustancias y eliminacion de metales pesados como el Hg. El cassette más frecuentemente hallado fue LysR (¡¿?!). Lo que más me gustó del trabajo fue la siguiente figura donde se muestra que la diversidad de cassettes en el ambiente es mucho mayor que la de “especies” bacterianas que en las arqueas. Lo cual nos dice que al menos en este ambiente las bacterias son mucho más elásticas que las arqueas. Muy muy bonito…
Otra cosa, ¿y si sondearamos otros ambientes? ¿Cómo evolucionaria el perfil de cassettes si se dejara de contaminar la Bahía?
Integron gene cassettes and degradation of compounds associated with industrial
waste: the case of the Sydney tar ponds. Koenig JE, Sharp C, Dlutek M, Curtis B, Joss M, Boucher Y, Doolittle WF.
PLoS ONE. 2009;4(4):e5276.

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Conjugación en vivo y en directo!


En este trabajo se logra algo nunca antes visto: ver la transferencia lateral de genes en el momento. El grupo de Miroslav Radman creó un sistema muy original. Primero crean una proteina de fusiòn entre el gen que codifica para la proteina amarilla fluorescente(YFP) y el que codifica para SeqA, proteina que se une sòlamente al ADN hemimetilado. Este gen al ecpresarse en el cromosoma de una bacteria dam- (que por lo tanto no metilan su ADN) produce una imagen difusa verde en todo el citoplasma. Por otro lado generan bacterias dam+ con el gen la proteìna roja fluorescente(RFP) en el cromosoma que ademàs poseen con un plásmido F’ . Cuando conjugan ambas bacterias el ADN metilado del plasmido F’ ingresa como simple cadena. Al generarse la cadena complementaria en la bacteria dam- el plàsmido F’ queda hemimetilado y une SeqA-YFP generandose fluorescencia intensa puntual! Impresionante. Pero ademàs se reflotan una vieja discusiones: en la conjugaciòn cuàl es la funciòn del pilus? Hay 2 ideas aceptadas. El pilii sòlo acerca a las bacterias y el ADN entra por un poro. La otra es que el ADN puede transferirse tambien a distancia. En este caso ven tranferencia del ADN a distancia!!!
VIDEO DE LA CONJUGACION

VIDEO DE CONJUGACION A DISTANCIA

Polución de ADN


Este es un artículo de divulgación de muy buen nivel. La resistencia a antibioticos es una amenaza cada vez más grande. En USA, sólamente el MRSA (Staphilococcus aureus resistente a meticilina) mata a 18.000 por año, màs que el SIDA. Los nuevos microbios resistentes estàn implicados en las màs de 90.000 infecciones potencialmente letales al año en USA, un numero mayor a las muertes por asesinatos y accidentes de transito sumadas. Otro estudio encontro que el 97% de las bocas de niños de jardìn de infantes posee bacterias resistentes a 4 o más antibióticos. Hasta hace poco se buscaba solamente la resistencia a los antibióticos en la clínica. Hoy por hoy tambien se busca en la comunidad (fuera de los hospitales) Un nuevo enfoque va màs allà: se buscan las reistencias por venir, las que estan en el ambiente y aún no se han seleccionado: el RESISTOMA. La idea es anticiparse a la resistencia buscando las resistencias directamentre de su fuente: el ambiente. Si tiene menos influencia del hombre mejor. En la foto vemos una chica buscando muestras en un rio congelado.
El articulo es muy claro, nos mete de lleno en la temática y entrevistan a los mejores especialistas en el área de resistencia a antibióticos: Stewart Levy, Gerry Wright por mencionar a los que conozco. Es largo pero lo recomiendo mucho.